Η Ειρήνη Παπαδάκη έκανε προπτυχιακές σπουδές στη Σχολή Ανθρωπιστικών Σπουδών στο Ελληνικό Ανοικτό Πανεπιστήμιο και μεταπτυχιακές σπουδές στο Τμήμα Κοινωνικής Ανθρωπολογίας και Ιστορίας του Πανεπιστημίου Αιγαίου. Αυτή την περίοδο ολοκληρώνει τη διδακτορική της διατριβή στο ίδιο Τμήμα με θέμα "Οι Πολιτικές της Υιοθεσίας στη Σύγχρονη Ελλάδα. Μία Εθνογραφική Προσέγγιση".